Der var flere grunde til Struensees fald. Affæren med dronning Karoline Mathilde. Affæren med dronning Karoline Mathilde var nok ikke den smarteste idé og hvis kongen ikke var så svag og syg som han nu var, havde Struensee nok ikke kommet langt. Men affæren kom dog til at koste dem dyrt, ikke fordi kongen gjorde noget, men fordi dronning Karoline Mathilde fødte sit andet barn, Louise Augusta. Folket vidste på dette tidspunkt at Struensee og dronning Karoline Mathilde havde en affære og vidste derfor at barnets fader ikke var Christian VII, men Struensee. Juliane Maria havde på dette tidspunkt en søn, som efter hendes mening, skule være konge af Danmark og dette ville være nemt nok da Christian VII var syg og kronprinsen på dette tidspunkt stadig var syg efter udbruddet af kopper. Juliane Marie besluttede sig at lave et kup på Struensee og dette fandt sted d. 15. januar.
Folket havde en indflydelse på Struensees fald og det kan vi læse ud fra et smædevers. Smædeverset var skrevet i 1772 og blev publiceret i en avis. Smædeverset beskrev Struensees styreform, hvordan han kneb befolkningen så de lyttede til ham og folkets had spillede senere en lille rolle i hans fald og senere henrettelse. Grunden til alt hadet kun være pga. alle de nedskæringer han havde på ansatte m.m. og alle de forandringer han lavede, love etc. og hvor hurtigt de kom efter hinanden.
Militæret havde en stor rolle i Struensees fald. Citatet her viser hvad den største fejl han begik. ”Struensee havde på dette tidspunkt begået den største fejl, der er muligt at begå, hvis man ønsker at kontrollere og reformere et land på trods af modstand af befolkningen og embedsmænd. Han havde påbegyndt om rokeringer og nedskæringer af militæret”, det er selvfølgeligt logisk nok, at hvis man har modstand fra befolkningen, så er det nok ikke så godt ikke at have nogen til at beskytte sig hvis folket gjorde oprør. Ludvig Köller og Eickstadt (to officerer i det danske militær) var på dette tidspunkt ikke glade for Struensees nedskæringer og ønsker ham dermed af posten som hersker af Danmark. De fik Chancen d. 15. januar da det kende kup fandt sted.